C’est autour de la chapelle que l’on a retrouvé les plus anciennes traces d’occupation humaine du site de Mèze (supposées du VIIIème siècle av. J.-C), c’est dire l’importance du site qu’occupe la chapelle des Pénitents. Ancienne église paroissiale Saint-Pierre, la chapelle est même bâtie sur le site d’un temple antique fondé par les grecs. Elle surplombe le vieux port et l’ancienne ville de Mèze.

On sait qu’une première église fût construite (elle est citée en 844) au Moyen-Age à cet endroit, mais les plus anciens murs de la chapelle proviennent de l’église romane construite au XIIème siècle. De cette époque ont survécu le choeur, l’abside semi-circulaire et les dernières travées des murs de la nef. En mauvais état, l’église a été restauré par les pénitents au XVIIème siècle, la façade et la porte furent remontées au XIXème siècle. La restauration se poursuit pour mettre en valeur ce bâtiment important d’une des plus anciennes villes de l’Hérault. Elle accueille aujourd’hui régulièrement des expositions.